Index

A

acgt() (in module sequenza.pileup)

acgt_genotype() (in module sequenza.seqz)

B

bam_mpileup (class in sequenza.samtools)

F

Fasta (class in sequenza.fasta)

I

indexed_pileup (class in sequenza.samtools)

P

pileup_acgt() (in module sequenza.pileup)

program_version() (in module sequenza.samtools)

S

sequenza.fasta (module) sequenza.izip (module) sequenza.pileup (module)

sequenza.samtools (module) sequenza.seqz (module) sequenza.vcf (module) sequenza.wig (module)

T

tabix_seqz() (in module sequenza.samtools)

U

unpack_data() (in module sequenza.seqz)

V

vcf_headline_content() (in module sequenza.vcf)

vcf_parse() (in module sequenza.vcf)

W

Wiggle (class in sequenza.wig)

WiggleError

Z

zip_coordinates (class in sequenza.izip)

zip_fast() (in module sequenza.izip)